Os Centros de Inovação (CITs) estão presentes nos 8 institutos do complexo e têm como objetivos.
Já os laboratórios são infraestruturas especializadas em tecnologias como inteligência artificial e cirurgia minimamente invasiva para apoiar o desenvolvimento de inovações nestas áreas independente da especialidade em saúde.
O Inova InCor nasceu como um Núcleo de Projetos do InCor e FZ com objetivo de gerar soluções que atendam às necessidades de cunho social, no campo das ciências da vida, principalmente relacionadas às áreas cardiovascular e respiratória
O Centro de Inovação Tecnológica do Instituto Central apoia iniciativas deste instituto através de iniciativas como o Inovação de Quarta e outros
O Inova IMREA promove a inovação em produtos, serviços e gestão em saúde para o cuidado integral em reabilitação e a melhoria da qualidade de vida das pessoas com condições de saúde incapacitantes
O Inova Ipq é o Centro de Inovação tecnológico do Instituto de Psiquiatria
O Inova ICESP tem como finalidade identificar, orientar, selecionar e apoiar projetos de inovação com foco no paciente oncológico, além de fomentar a inovação e o empreendedorismo no instituto
O Inova IoT apoia projetos de inovação de produtos, serviços e processos na área de ortopedia
O Inova Inrad apoia projetos de inovação de produtos, serviços e processos na área de radiologia
O Inova Icr apoia projetos de inovação de produtos, serviços e processos na área de pediatria
O In.lab é o laboratório de inteligência artificial que apoia os projetos de inovação na área de ciência de dados
O LEPIC é o laboratório de ensino, pesquisa e inovação em cirurgia que apoia projetos na área de cirurgia minimamente invasiva.